Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR9

REEP6, Receptor expression-enhancing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP6Q96HR9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP6Q96HR9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP6Q96HR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP6Q96HR9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP6Q96HR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP6Q96HR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms