Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53INP1Q96A56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53INP1Q96A56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53INP1Q96A56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53INP1Q96A56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53INP1Q96A56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms