Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DPF3Q92784 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DPF3Q92784 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DPF3Q92784 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DPF3Q92784 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DPF3Q92784 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DPF3Q92784 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DPF3Q92784 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DPF3Q92784 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DPF3Q92784 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DPF3Q92784 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DPF3Q92784 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DPF3Q92784 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms