Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB22

SPATA20, Spermatogenesis-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20Q8TB22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA20Q8TB22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPATA20Q8TB22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPATA20Q8TB22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA20Q8TB22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA20Q8TB22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPATA20Q8TB22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPATA20Q8TB22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms