Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHE22Q8NFJ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BHLHE22Q8NFJ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHLHE22Q8NFJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHLHE22Q8NFJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms