Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPICQ8N5J4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPICQ8N5J4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPICQ8N5J4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms