Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PROM2Q8N271 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PROM2Q8N271 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PROM2Q8N271 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PROM2Q8N271 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PROM2Q8N271 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PROM2Q8N271 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PROM2Q8N271 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PROM2Q8N271 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms