Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE1Q8N0S2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCE1Q8N0S2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE1Q8N0S2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCE1Q8N0S2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCE1Q8N0S2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE1Q8N0S2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms