Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y25

ZNF354C, Zinc finger protein 354C, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354CQ86Y25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF354CQ86Y25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF354CQ86Y25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF354CQ86Y25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF354CQ86Y25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF354CQ86Y25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF354CQ86Y25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF354CQ86Y25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF354CQ86Y25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms