Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED4Q7Z7H5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED4Q7Z7H5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED4Q7Z7H5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED4Q7Z7H5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms