Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDDC2Q7Z4H3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDDC2Q7Z4H3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDDC2Q7Z4H3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms