Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PAXIP1Q6ZW49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAXIP1Q6ZW49 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PAXIP1Q6ZW49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PAXIP1Q6ZW49 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAXIP1Q6ZW49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAXIP1Q6ZW49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAXIP1Q6ZW49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAXIP1Q6ZW49 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAXIP1Q6ZW49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms