Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE1Q6ZW31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE1Q6ZW31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYDE1Q6ZW31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE1Q6ZW31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE1Q6ZW31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYDE1Q6ZW31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYDE1Q6ZW31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms