Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK4Q6UW60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK4Q6UW60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK4Q6UW60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK4Q6UW60 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK4Q6UW60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK4Q6UW60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms