Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LLGL2Q6P1M3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LLGL2Q6P1M3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LLGL2Q6P1M3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LLGL2Q6P1M3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LLGL2Q6P1M3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LLGL2Q6P1M3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms