Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAAP20Q6NZ36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAAP20Q6NZ36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAAP20Q6NZ36 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAAP20Q6NZ36 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAAP20Q6NZ36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAAP20Q6NZ36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAAP20Q6NZ36 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAAP20Q6NZ36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAAP20Q6NZ36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms