Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN54Q6MZP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN54Q6MZP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN54Q6MZP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN54Q6MZP7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN54Q6MZP7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN54Q6MZP7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN54Q6MZP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN54Q6MZP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN54Q6MZP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms