Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYW3Q6IPR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYW3Q6IPR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYW3Q6IPR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TYW3Q6IPR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TYW3Q6IPR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms