Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR4

OTP, Homeobox protein orthopedia, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTPQ5XKR4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTPQ5XKR4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTPQ5XKR4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTPQ5XKR4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1229.1 ms