Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHEQ5VZ18 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHEQ5VZ18 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHEQ5VZ18 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHEQ5VZ18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHEQ5VZ18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms