Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MEX3CQ5U5Q3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MEX3CQ5U5Q3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MEX3CQ5U5Q3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MEX3CQ5U5Q3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
MEX3CQ5U5Q3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MEX3CQ5U5Q3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MEX3CQ5U5Q3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
MEX3CQ5U5Q3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MEX3CQ5U5Q3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MEX3CQ5U5Q3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MEX3CQ5U5Q3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
MEX3CQ5U5Q3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MEX3CQ5U5Q3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms