Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
L1TD1Q5T7N2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
L1TD1Q5T7N2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
L1TD1Q5T7N2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
L1TD1Q5T7N2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
L1TD1Q5T7N2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms