Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SNAPC4Q5SXM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SNAPC4Q5SXM2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SNAPC4Q5SXM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
SNAPC4Q5SXM2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SNAPC4Q5SXM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.41■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SNAPC4Q5SXM2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SNAPC4Q5SXM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SNAPC4Q5SXM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
SNAPC4Q5SXM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
SNAPC4Q5SXM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SNAPC4Q5SXM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SNAPC4Q5SXM2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SNAPC4Q5SXM2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SNAPC4Q5SXM2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SNAPC4Q5SXM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms