Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCBP3Q53F19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCBP3Q53F19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCBP3Q53F19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCBP3Q53F19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCBP3Q53F19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCBP3Q53F19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCBP3Q53F19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCBP3Q53F19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCBP3Q53F19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NCBP3Q53F19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCBP3Q53F19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms