Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAL1Q4LDG9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAL1Q4LDG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAL1Q4LDG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAL1Q4LDG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAL1Q4LDG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAL1Q4LDG9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAL1Q4LDG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAL1Q4LDG9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms