Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LONRF2Q1L5Z9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LONRF2Q1L5Z9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF2Q1L5Z9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF2Q1L5Z9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF2Q1L5Z9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF2Q1L5Z9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF2Q1L5Z9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF2Q1L5Z9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms