Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms