Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF9Q13886 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF9Q13886 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF9Q13886 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF9Q13886 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF9Q13886 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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