Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHROOM2Q13796 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SHROOM2Q13796 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SHROOM2Q13796 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM2Q13796 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM2Q13796 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM2Q13796 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SHROOM2Q13796 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
SHROOM2Q13796 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM2Q13796 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SHROOM2Q13796 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM2Q13796 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SHROOM2Q13796 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
SHROOM2Q13796 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SHROOM2Q13796 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SHROOM2Q13796 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
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