Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPB3Q12988 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSPB3Q12988 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPB3Q12988 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPB3Q12988 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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