Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXC1Q12948 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXC1Q12948 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXC1Q12948 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXC1Q12948 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXC1Q12948 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXC1Q12948 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXC1Q12948 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXC1Q12948 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXC1Q12948 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXC1Q12948 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXC1Q12948 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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