Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
GOLGA3Q08378 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.25■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
GOLGA3Q08378 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.19■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
GOLGA3Q08378 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
GOLGA3Q08378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
GOLGA3Q08378 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
GOLGA3Q08378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
GOLGA3Q08378 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
GOLGA3Q08378 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
GOLGA3Q08378 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.94■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
GOLGA3Q08378 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
GOLGA3Q08378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.83■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
GOLGA3Q08378 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
GOLGA3Q08378 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
GOLGA3Q08378 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms