Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARID5AQ03989 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID5AQ03989 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID5AQ03989 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID5AQ03989 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID5AQ03989 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms