Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR3P61158 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR3P61158 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR3P61158 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR3P61158 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR3P61158 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR3P61158 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms