Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPI1P60174 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPI1P60174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPI1P60174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPI1P60174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPI1P60174 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPI1P60174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPI1P60174 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPI1P60174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPI1P60174 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPI1P60174 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPI1P60174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPI1P60174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPI1P60174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPI1P60174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPI1P60174 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TPI1P60174 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPI1P60174 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPI1P60174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPI1P60174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPI1P60174 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPI1P60174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPI1P60174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPI1P60174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPI1P60174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPI1P60174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPI1P60174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPI1P60174 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPI1P60174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPI1P60174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPI1P60174 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPI1P60174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPI1P60174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPI1P60174 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPI1P60174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPI1P60174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPI1P60174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPI1P60174 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPI1P60174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPI1P60174 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPI1P60174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TPI1P60174 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPI1P60174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPI1P60174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPI1P60174 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPI1P60174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPI1P60174 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPI1P60174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPI1P60174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPI1P60174 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPI1P60174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPI1P60174 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPI1P60174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPI1P60174 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPI1P60174 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPI1P60174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPI1P60174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPI1P60174 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPI1P60174 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPI1P60174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPI1P60174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPI1P60174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPI1P60174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPI1P60174 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPI1P60174 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPI1P60174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TPI1P60174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPI1P60174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPI1P60174 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPI1P60174 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPI1P60174 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPI1P60174 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPI1P60174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPI1P60174 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPI1P60174 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPI1P60174 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPI1P60174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPI1P60174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPI1P60174 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPI1P60174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPI1P60174 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TPI1P60174 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPI1P60174 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPI1P60174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPI1P60174 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPI1P60174 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPI1P60174 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TPI1P60174 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPI1P60174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPI1P60174 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms