Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMP3P54852 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMP3P54852 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMP3P54852 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMP3P54852 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EMP3P54852 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMP3P54852 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMP3P54852 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMP3P54852 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMP3P54852 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMP3P54852 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMP3P54852 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMP3P54852 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMP3P54852 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMP3P54852 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMP3P54852 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMP3P54852 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMP3P54852 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMP3P54852 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMP3P54852 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMP3P54852 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMP3P54852 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMP3P54852 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMP3P54852 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMP3P54852 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMP3P54852 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMP3P54852 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMP3P54852 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMP3P54852 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMP3P54852 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMP3P54852 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EMP3P54852 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMP3P54852 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMP3P54852 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMP3P54852 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMP3P54852 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMP3P54852 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMP3P54852 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMP3P54852 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMP3P54852 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EMP3P54852 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMP3P54852 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMP3P54852 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMP3P54852 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMP3P54852 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMP3P54852 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMP3P54852 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMP3P54852 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMP3P54852 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMP3P54852 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMP3P54852 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMP3P54852 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMP3P54852 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMP3P54852 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMP3P54852 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMP3P54852 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMP3P54852 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMP3P54852 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EMP3P54852 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EMP3P54852 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMP3P54852 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMP3P54852 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMP3P54852 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMP3P54852 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMP3P54852 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EMP3P54852 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMP3P54852 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMP3P54852 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMP3P54852 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMP3P54852 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMP3P54852 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMP3P54852 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMP3P54852 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMP3P54852 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMP3P54852 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EMP3P54852 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMP3P54852 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMP3P54852 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms