Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA2P52926 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA2P52926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGA2P52926 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGA2P52926 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGA2P52926 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms