Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN2P51788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN2P51788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN2P51788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLCN2P51788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLCN2P51788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms