Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF144AP50876 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF144AP50876 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF144AP50876 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF144AP50876 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF144AP50876 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF144AP50876 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms