Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XCR1P46094 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XCR1P46094 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XCR1P46094 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XCR1P46094 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XCR1P46094 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XCR1P46094 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XCR1P46094 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XCR1P46094 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XCR1P46094 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XCR1P46094 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XCR1P46094 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XCR1P46094 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XCR1P46094 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XCR1P46094 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XCR1P46094 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XCR1P46094 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XCR1P46094 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XCR1P46094 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XCR1P46094 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XCR1P46094 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XCR1P46094 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XCR1P46094 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XCR1P46094 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XCR1P46094 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XCR1P46094 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XCR1P46094 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XCR1P46094 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XCR1P46094 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XCR1P46094 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XCR1P46094 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XCR1P46094 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XCR1P46094 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XCR1P46094 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XCR1P46094 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XCR1P46094 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XCR1P46094 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XCR1P46094 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XCR1P46094 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XCR1P46094 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XCR1P46094 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XCR1P46094 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XCR1P46094 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XCR1P46094 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XCR1P46094 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XCR1P46094 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XCR1P46094 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XCR1P46094 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XCR1P46094 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XCR1P46094 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XCR1P46094 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XCR1P46094 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XCR1P46094 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
XCR1P46094 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XCR1P46094 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XCR1P46094 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XCR1P46094 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XCR1P46094 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XCR1P46094 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XCR1P46094 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XCR1P46094 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XCR1P46094 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XCR1P46094 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XCR1P46094 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XCR1P46094 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XCR1P46094 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XCR1P46094 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XCR1P46094 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XCR1P46094 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XCR1P46094 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XCR1P46094 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XCR1P46094 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XCR1P46094 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XCR1P46094 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XCR1P46094 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XCR1P46094 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XCR1P46094 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XCR1P46094 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XCR1P46094 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XCR1P46094 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XCR1P46094 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XCR1P46094 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XCR1P46094 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XCR1P46094 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XCR1P46094 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms