Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAGEA3P43357 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEA3P43357 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAGEA3P43357 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA3P43357 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAGEA3P43357 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA3P43357 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA3P43357 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA3P43357 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms