Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
NCAPD3P42695 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
NCAPD3P42695 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
NCAPD3P42695 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC48.3■■■■■ 5.32
NCAPD3P42695 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NCAPD3P42695 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
NCAPD3P42695 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
NCAPD3P42695 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC48.19■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.17■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NCAPD3P42695 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NCAPD3P42695 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NCAPD3P42695 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NCAPD3P42695 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NCAPD3P42695 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC47.88■■■■■ 5.25
NCAPD3P42695 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
NCAPD3P42695 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NCAPD3P42695 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NCAPD3P42695 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NCAPD3P42695 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
NCAPD3P42695 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NCAPD3P42695 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NCAPD3P42695 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.57■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NCAPD3P42695 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
NCAPD3P42695 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms