Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBL1P41271 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBL1P41271 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBL1P41271 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBL1P41271 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBL1P41271 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBL1P41271 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBL1P41271 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBL1P41271 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBL1P41271 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBL1P41271 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBL1P41271 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBL1P41271 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBL1P41271 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBL1P41271 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBL1P41271 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBL1P41271 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBL1P41271 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBL1P41271 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NBL1P41271 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBL1P41271 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBL1P41271 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBL1P41271 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBL1P41271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBL1P41271 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBL1P41271 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBL1P41271 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBL1P41271 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBL1P41271 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NBL1P41271 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBL1P41271 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBL1P41271 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBL1P41271 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBL1P41271 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBL1P41271 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBL1P41271 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NBL1P41271 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBL1P41271 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBL1P41271 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBL1P41271 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBL1P41271 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBL1P41271 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBL1P41271 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBL1P41271 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBL1P41271 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBL1P41271 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBL1P41271 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBL1P41271 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBL1P41271 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NBL1P41271 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NBL1P41271 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBL1P41271 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBL1P41271 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBL1P41271 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBL1P41271 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBL1P41271 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBL1P41271 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBL1P41271 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBL1P41271 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBL1P41271 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBL1P41271 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBL1P41271 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBL1P41271 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBL1P41271 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBL1P41271 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBL1P41271 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBL1P41271 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBL1P41271 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBL1P41271 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBL1P41271 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBL1P41271 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBL1P41271 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBL1P41271 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBL1P41271 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBL1P41271 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBL1P41271 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBL1P41271 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBL1P41271 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBL1P41271 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBL1P41271 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBL1P41271 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBL1P41271 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBL1P41271 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBL1P41271 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBL1P41271 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBL1P41271 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBL1P41271 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBL1P41271 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBL1P41271 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBL1P41271 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBL1P41271 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBL1P41271 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBL1P41271 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBL1P41271 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBL1P41271 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBL1P41271 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBL1P41271 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBL1P41271 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBL1P41271 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBL1P41271 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms