Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDH1P40925 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDH1P40925 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDH1P40925 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDH1P40925 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDH1P40925 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDH1P40925 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDH1P40925 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDH1P40925 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDH1P40925 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDH1P40925 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDH1P40925 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDH1P40925 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDH1P40925 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDH1P40925 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDH1P40925 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDH1P40925 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDH1P40925 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDH1P40925 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDH1P40925 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDH1P40925 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDH1P40925 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDH1P40925 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDH1P40925 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDH1P40925 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDH1P40925 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDH1P40925 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDH1P40925 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDH1P40925 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDH1P40925 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDH1P40925 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDH1P40925 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDH1P40925 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDH1P40925 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDH1P40925 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDH1P40925 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDH1P40925 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDH1P40925 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDH1P40925 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MDH1P40925 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDH1P40925 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDH1P40925 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDH1P40925 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDH1P40925 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDH1P40925 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDH1P40925 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDH1P40925 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDH1P40925 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDH1P40925 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDH1P40925 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDH1P40925 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDH1P40925 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDH1P40925 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDH1P40925 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDH1P40925 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDH1P40925 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDH1P40925 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDH1P40925 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDH1P40925 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDH1P40925 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDH1P40925 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDH1P40925 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDH1P40925 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDH1P40925 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDH1P40925 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDH1P40925 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDH1P40925 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDH1P40925 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDH1P40925 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDH1P40925 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDH1P40925 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MDH1P40925 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDH1P40925 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDH1P40925 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDH1P40925 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDH1P40925 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDH1P40925 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDH1P40925 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MDH1P40925 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDH1P40925 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDH1P40925 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDH1P40925 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDH1P40925 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDH1P40925 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDH1P40925 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDH1P40925 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MDH1P40925 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDH1P40925 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDH1P40925 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDH1P40925 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms