Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPAP38571 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPAP38571 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIPAP38571 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPAP38571 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPAP38571 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPAP38571 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPAP38571 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPAP38571 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPAP38571 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPAP38571 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPAP38571 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPAP38571 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPAP38571 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPAP38571 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPAP38571 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPAP38571 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPAP38571 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPAP38571 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPAP38571 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPAP38571 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPAP38571 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPAP38571 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPAP38571 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPAP38571 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPAP38571 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPAP38571 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPAP38571 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPAP38571 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPAP38571 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPAP38571 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPAP38571 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPAP38571 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPAP38571 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPAP38571 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPAP38571 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPAP38571 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPAP38571 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPAP38571 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPAP38571 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPAP38571 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPAP38571 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPAP38571 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPAP38571 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPAP38571 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPAP38571 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPAP38571 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPAP38571 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPAP38571 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPAP38571 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIPAP38571 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIPAP38571 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIPAP38571 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPAP38571 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPAP38571 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPAP38571 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPAP38571 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPAP38571 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPAP38571 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPAP38571 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPAP38571 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIPAP38571 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LIPAP38571 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIPAP38571 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIPAP38571 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPAP38571 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPAP38571 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPAP38571 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPAP38571 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPAP38571 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPAP38571 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPAP38571 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPAP38571 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPAP38571 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPAP38571 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPAP38571 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPAP38571 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPAP38571 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPAP38571 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPAP38571 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPAP38571 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPAP38571 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPAP38571 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPAP38571 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPAP38571 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPAP38571 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPAP38571 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPAP38571 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms