Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CPS1P31327 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CPS1P31327 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CPS1P31327 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CPS1P31327 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CPS1P31327 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CPS1P31327 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CPS1P31327 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CPS1P31327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CPS1P31327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CPS1P31327 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CPS1P31327 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CPS1P31327 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CPS1P31327 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CPS1P31327 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
CPS1P31327 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CPS1P31327 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CPS1P31327 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CPS1P31327 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CPS1P31327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CPS1P31327 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CPS1P31327 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CPS1P31327 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CPS1P31327 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CPS1P31327 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CPS1P31327 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CPS1P31327 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CPS1P31327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CPS1P31327 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CPS1P31327 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CPS1P31327 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CPS1P31327 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CPS1P31327 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CPS1P31327 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CPS1P31327 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CPS1P31327 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CPS1P31327 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CPS1P31327 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CPS1P31327 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CPS1P31327 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CPS1P31327 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CPS1P31327 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CPS1P31327 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CPS1P31327 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CPS1P31327 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CPS1P31327 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CPS1P31327 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CPS1P31327 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CPS1P31327 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CPS1P31327 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CPS1P31327 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CPS1P31327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CPS1P31327 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CPS1P31327 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CPS1P31327 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CPS1P31327 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPS1P31327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CPS1P31327 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CPS1P31327 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CPS1P31327 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPS1P31327 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPS1P31327 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPS1P31327 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPS1P31327 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CPS1P31327 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CPS1P31327 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CPS1P31327 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CPS1P31327 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CPS1P31327 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CPS1P31327 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CPS1P31327 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CPS1P31327 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CPS1P31327 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CPS1P31327 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CPS1P31327 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CPS1P31327 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CPS1P31327 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CPS1P31327 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPS1P31327 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPS1P31327 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CPS1P31327 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CPS1P31327 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CPS1P31327 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CPS1P31327 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CPS1P31327 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CPS1P31327 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CPS1P31327 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CPS1P31327 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CPS1P31327 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CPS1P31327 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CPS1P31327 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CPS1P31327 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CPS1P31327 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CPS1P31327 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms