Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK1P30085 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK1P30085 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMPK1P30085 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMPK1P30085 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMPK1P30085 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMPK1P30085 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms