Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD3P28288 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCD3P28288 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCD3P28288 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD3P28288 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD3P28288 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms