Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DMAP28067 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DMAP28067 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DMAP28067 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DMAP28067 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DMAP28067 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms