Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALB2P22676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALB2P22676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALB2P22676 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALB2P22676 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALB2P22676 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB2P22676 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB2P22676 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CALB2P22676 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB2P22676 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB2P22676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB2P22676 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB2P22676 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB2P22676 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB2P22676 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB2P22676 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB2P22676 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB2P22676 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB2P22676 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB2P22676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB2P22676 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB2P22676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB2P22676 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB2P22676 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms