Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALB2P22676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALB2P22676 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALB2P22676 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALB2P22676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALB2P22676 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALB2P22676 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALB2P22676 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB2P22676 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB2P22676 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB2P22676 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB2P22676 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB2P22676 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB2P22676 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CALB2P22676 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB2P22676 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB2P22676 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB2P22676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB2P22676 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB2P22676 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB2P22676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB2P22676 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB2P22676 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB2P22676 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB2P22676 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB2P22676 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB2P22676 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB2P22676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB2P22676 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB2P22676 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB2P22676 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB2P22676 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB2P22676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB2P22676 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB2P22676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB2P22676 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB2P22676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB2P22676 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB2P22676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB2P22676 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB2P22676 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB2P22676 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB2P22676 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms